Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC8Q9H0W5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC8Q9H0W5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
CCDC8Q9H0W5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC8Q9H0W5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC8Q9H0W5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms