Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF3Q9H094 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NBPF3Q9H094 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NBPF3Q9H094 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NBPF3Q9H094 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms