Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP6Q9GZR1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SENP6Q9GZR1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SENP6Q9GZR1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SENP6Q9GZR1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms