Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP44Q9C0F1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP44Q9C0F1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CEP44Q9C0F1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms