Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUF2Q9BZD4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUF2Q9BZD4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUF2Q9BZD4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUF2Q9BZD4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUF2Q9BZD4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUF2Q9BZD4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms