Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR2

KRTAP4-5, Keratin-associated protein 4-5, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-5Q9BYR2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP4-5Q9BYR2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP4-5Q9BYR2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms