Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPO3Q9BXY4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms