Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA4Q9BXL8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA4Q9BXL8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms