Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGPP1Q9BX95 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGPP1Q9BX95 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms