Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM4Q9BWF3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM4Q9BWF3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM4Q9BWF3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM4Q9BWF3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM4Q9BWF3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM4Q9BWF3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM4Q9BWF3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms