Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM2Q9BVW6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM2Q9BVW6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms