Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT11Q9BT88 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT11Q9BT88 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms