Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCM2Q9BSQ5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCM2Q9BSQ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCM2Q9BSQ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCM2Q9BSQ5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms