Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSK4

FEM1A, Protein fem-1 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEM1AQ9BSK4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FEM1AQ9BSK4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FEM1AQ9BSK4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FEM1AQ9BSK4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FEM1AQ9BSK4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FEM1AQ9BSK4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms