Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD6Q9BRQ6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHCHD6Q9BRQ6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms