Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOXF2Q9BQY4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RHOXF2Q9BQY4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms