Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPOCK3Q9BQ16 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCK3Q9BQ16 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms