Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3AQ99856 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3AQ99856 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3AQ99856 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID3AQ99856 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3AQ99856 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3AQ99856 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3AQ99856 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3AQ99856 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3AQ99856 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ARID3AQ99856 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ARID3AQ99856 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ARID3AQ99856 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ARID3AQ99856 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ARID3AQ99856 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3AQ99856 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3AQ99856 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3AQ99856 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3AQ99856 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3AQ99856 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3AQ99856 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3AQ99856 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3AQ99856 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3AQ99856 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3AQ99856 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3AQ99856 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3AQ99856 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID3AQ99856 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3AQ99856 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3AQ99856 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3AQ99856 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3AQ99856 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms