Protein–RNA interactions for Protein: Q99828

CIB1, Calcium and integrin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB1Q99828 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIB1Q99828 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIB1Q99828 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIB1Q99828 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIB1Q99828 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIB1Q99828 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CIB1Q99828 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CIB1Q99828 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CIB1Q99828 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CIB1Q99828 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CIB1Q99828 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIB1Q99828 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CIB1Q99828 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms