Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIPEPQ99797 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIPEPQ99797 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIPEPQ99797 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MIPEPQ99797 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIPEPQ99797 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIPEPQ99797 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms