Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC6Q99741 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC6Q99741 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC6Q99741 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms