Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RGPD5Q99666 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RGPD5Q99666 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RGPD5Q99666 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD5Q99666 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms