Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHOX2BQ99453 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHOX2BQ99453 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHOX2BQ99453 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms