Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD7

PANX1, Pannexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1Q96RD7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX1Q96RD7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PANX1Q96RD7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms