Protein–RNA interactions for Protein: Q96QA5

GSDMA, Gasdermin-A, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMAQ96QA5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GSDMAQ96QA5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GSDMAQ96QA5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GSDMAQ96QA5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GSDMAQ96QA5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GSDMAQ96QA5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GSDMAQ96QA5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GSDMAQ96QA5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GSDMAQ96QA5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GSDMAQ96QA5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GSDMAQ96QA5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GSDMAQ96QA5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSDMAQ96QA5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSDMAQ96QA5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms