Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAMD11Q96NU1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SAMD11Q96NU1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SAMD11Q96NU1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms