Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFAP53Q96M91 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFAP53Q96M91 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFAP53Q96M91 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFAP53Q96M91 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFAP53Q96M91 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CFAP53Q96M91 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP53Q96M91 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFAP53Q96M91 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFAP53Q96M91 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CFAP53Q96M91 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CFAP53Q96M91 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFAP53Q96M91 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFAP53Q96M91 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFAP53Q96M91 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFAP53Q96M91 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CFAP53Q96M91 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CFAP53Q96M91 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CFAP53Q96M91 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CFAP53Q96M91 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CFAP53Q96M91 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CFAP53Q96M91 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CFAP53Q96M91 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CFAP53Q96M91 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CFAP53Q96M91 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CFAP53Q96M91 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CFAP53Q96M91 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CFAP53Q96M91 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CFAP53Q96M91 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
CFAP53Q96M91 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CFAP53Q96M91 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CFAP53Q96M91 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CFAP53Q96M91 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CFAP53Q96M91 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CFAP53Q96M91 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CFAP53Q96M91 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms