Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALPK3Q96L96 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALPK3Q96L96 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALPK3Q96L96 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
ALPK3Q96L96 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms