Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
EP400Q96L91 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
EP400Q96L91 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
EP400Q96L91 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
EP400Q96L91 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
EP400Q96L91 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
EP400Q96L91 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
EP400Q96L91 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
EP400Q96L91 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
EP400Q96L91 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
EP400Q96L91 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
EP400Q96L91 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
EP400Q96L91 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
EP400Q96L91 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
EP400Q96L91 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
EP400Q96L91 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
EP400Q96L91 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
EP400Q96L91 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms