Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RPGRIP1Q96KN7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPGRIP1Q96KN7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPGRIP1Q96KN7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms