Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS50Q96JG6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS50Q96JG6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS50Q96JG6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms