Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LOXL4Q96JB6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LOXL4Q96JB6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LOXL4Q96JB6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LOXL4Q96JB6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LOXL4Q96JB6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LOXL4Q96JB6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LOXL4Q96JB6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LOXL4Q96JB6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LOXL4Q96JB6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LOXL4Q96JB6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LOXL4Q96JB6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LOXL4Q96JB6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LOXL4Q96JB6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LOXL4Q96JB6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LOXL4Q96JB6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LOXL4Q96JB6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LOXL4Q96JB6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LOXL4Q96JB6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LOXL4Q96JB6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms