Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN17Q96FV3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN17Q96FV3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms