Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MVB12AQ96EY5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MVB12AQ96EY5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MVB12AQ96EY5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms