Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SLC10A4Q96EP9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC10A4Q96EP9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC10A4Q96EP9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC10A4Q96EP9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms