Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCN3Q96D15 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCN3Q96D15 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCN3Q96D15 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms