Protein–RNA interactions for Protein: Q96B96

TMEM159, Promethin, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM159Q96B96 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM159Q96B96 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM159Q96B96 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM159Q96B96 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM159Q96B96 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM159Q96B96 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM159Q96B96 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM159Q96B96 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM159Q96B96 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM159Q96B96 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM159Q96B96 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM159Q96B96 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM159Q96B96 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM159Q96B96 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM159Q96B96 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM159Q96B96 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM159Q96B96 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms