Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RFT1Q96AA3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms