Protein–RNA interactions for Protein: Q96A23

CPNE4, Copine-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE4Q96A23 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPNE4Q96A23 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE4Q96A23 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE4Q96A23 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE4Q96A23 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE4Q96A23 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE4Q96A23 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE4Q96A23 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE4Q96A23 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms