Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC102AQ96A19 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC102AQ96A19 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC102AQ96A19 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms