Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOP1MTQ969P6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1MTQ969P6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms