Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAMP4Q969E2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAMP4Q969E2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP4Q969E2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms