Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HLA-CQ95604 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HLA-CQ95604 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-CQ95604 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms