Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIFAP3Q92845 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIFAP3Q92845 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIFAP3Q92845 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KIFAP3Q92845 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KIFAP3Q92845 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms