Protein–RNA interactions for Protein: Q92832

NELL1, Protein kinase C-binding protein NELL1, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL1Q92832 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELL1Q92832 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELL1Q92832 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELL1Q92832 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms