Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DEPDC1BQ8WUY9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DEPDC1BQ8WUY9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DEPDC1BQ8WUY9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DEPDC1BQ8WUY9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DEPDC1BQ8WUY9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DEPDC1BQ8WUY9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DEPDC1BQ8WUY9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DEPDC1BQ8WUY9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DEPDC1BQ8WUY9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms