Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.98■■■■■ 5.43
RB1CC1Q8TDY2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC48.96■■■■■ 5.43
RB1CC1Q8TDY2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC48.94■■■■■ 5.43
RB1CC1Q8TDY2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
RB1CC1Q8TDY2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC48.93■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC48.92■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC48.92■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC48.92■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.92■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC48.91■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.91■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC48.9■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC48.9■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC48.89■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.89■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC48.89■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC48.88■■■■■ 5.42
RB1CC1Q8TDY2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.41
RB1CC1Q8TDY2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.41
RB1CC1Q8TDY2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
RB1CC1Q8TDY2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC48.87■■■■■ 5.41
RB1CC1Q8TDY2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC48.86■■■■■ 5.41
RB1CC1Q8TDY2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC48.86■■■■■ 5.41
RB1CC1Q8TDY2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
RB1CC1Q8TDY2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
RB1CC1Q8TDY2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
RB1CC1Q8TDY2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
RB1CC1Q8TDY2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
RB1CC1Q8TDY2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC48.83■■■■■ 5.41
RB1CC1Q8TDY2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC48.83■■■■■ 5.41
RB1CC1Q8TDY2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
RB1CC1Q8TDY2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC48.81■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC48.81■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC48.81■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC48.81■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC48.8■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC48.79■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.79■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC48.79■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC48.79■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC48.78■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC48.77■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC48.77■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC48.77■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC48.76■■■■■ 5.4
RB1CC1Q8TDY2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.74■■■■■ 5.39
RB1CC1Q8TDY2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC48.73■■■■■ 5.39
RB1CC1Q8TDY2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC48.73■■■■■ 5.39
RB1CC1Q8TDY2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC48.72■■■■■ 5.39
RB1CC1Q8TDY2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
RB1CC1Q8TDY2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
RB1CC1Q8TDY2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC48.71■■■■■ 5.39
RB1CC1Q8TDY2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC48.7■■■■■ 5.39
RB1CC1Q8TDY2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC48.7■■■■■ 5.39
RB1CC1Q8TDY2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.38
RB1CC1Q8TDY2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC48.67■■■■■ 5.38
RB1CC1Q8TDY2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
RB1CC1Q8TDY2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.64■■■■■ 5.38
RB1CC1Q8TDY2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC48.64■■■■■ 5.38
RB1CC1Q8TDY2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC48.64■■■■■ 5.38
RB1CC1Q8TDY2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC48.64■■■■■ 5.38
RB1CC1Q8TDY2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.64■■■■■ 5.38
RB1CC1Q8TDY2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
RB1CC1Q8TDY2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
RB1CC1Q8TDY2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC48.62■■■■■ 5.37
RB1CC1Q8TDY2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
RB1CC1Q8TDY2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
RB1CC1Q8TDY2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC48.59■■■■■ 5.37
RB1CC1Q8TDY2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
RB1CC1Q8TDY2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
RB1CC1Q8TDY2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.56■■■■■ 5.36
RB1CC1Q8TDY2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC48.56■■■■■ 5.36
RB1CC1Q8TDY2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
RB1CC1Q8TDY2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.53■■■■■ 5.36
RB1CC1Q8TDY2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.53■■■■■ 5.36
RB1CC1Q8TDY2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC48.51■■■■■ 5.36
RB1CC1Q8TDY2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC48.51■■■■■ 5.36
RB1CC1Q8TDY2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.5■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC48.49■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC48.49■■■■■ 5.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms