Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNPDA2Q8TDQ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPDA2Q8TDQ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPDA2Q8TDQ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 333 ms