Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD5Q8TDI0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHD5Q8TDI0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHD5Q8TDI0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD5Q8TDI0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms