Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC71

SPATA18, Mitochondria-eating protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18Q8TC71 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPATA18Q8TC71 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SPATA18Q8TC71 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPATA18Q8TC71 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPATA18Q8TC71 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
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